表面活性劑符合功能性食品和綠色食品添加劑的要求，可應用在功能性食品中，在人類崇尚健康至上的今天乃至將來，必將成為一種廣泛應用的食品添加劑。用生物表面活性劑修復被烴類和原油污染的土壤是一種新技術。
如用綠膿假單孢菌產生的鼠李清除了阿拉斯加砂礫層的大量的油。VanDyke等發現，從污染的砂土和泥漿中，用綠膿假單孢菌產生的鼠李糖脂可使烴類的回收率分別提高25%~70%和40%~80%。相似的，用綠膿假單孢菌產生的生物表面活性劑處理砂土，可分別使脂肪旋烴類和芳香族烴類的回收率達56%和73%。
生物表面活性劑也可乳化烴類和水的混合液，這個特性可顯著增加烴類的降解，有在漏油管理的潛在應用價值。人們已從水中分離到能降解碳氫化合物的微生物：銅綠假單孢菌（Pseudomonas aeruginasa）SB30產的一種乳化劑能迅速將油分散為小滴，可在海灘除污中有所作為；Dave等近來發現，石油化學工業漏出的油對土壤的污染，能用可降解烴類的微生物來進行生物修復；Deziel等報道了綠膿假單孢菌19SJ可通過利用多環芳香族烴類產生生物表面活性劑。
在食品工業中生物表面活性劑可作為食品添加劑。卵磷脂和它的衍生物、含甘油的脂肪脂、山梨聚糖、乙烯乙二醇、甘油單酸酯的衍生物，以及近來合成的低聚肽，都在食品工業中廣泛用作乳化劑。乳化劑不僅在分散中發揮作用，也對產品形成合適的粘度和質地有很大作用。
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