某些材料常用的添加型阻燃劑，在材料加工溫度下可能會發生少量分解，這一方面限制了某些阻燃劑的使用，另一方面也限制了阻燃材料所采用的加工溫度。有很多添加型阻燃劑是填料型的，而為了使材料達到所要求的阻燃級別，往往所需要的添加量較大，因而難于全部在聚合物基體中均勻分散，這又可能降低材料的某些性能。

材料常用的鹵系阻燃劑與氧化銻組成的協效系統，雖然能賦予材料很高的氧指數與UL94阻燃級別，能滿足很多對火災要求嚴格場所的使用范圍，但此系統熱解及燃燒的時候發煙量比較大，且產生有毒和腐蝕性氣體。而當固態阻燃劑的用量很高時，它們熔融聚合物中也難于分散均勻，不良的分散會加劇聚合物的脆性，也會降低阻燃效果。將阻燃劑制成母粒（加工成本過高），或用偶聯劑對阻燃劑進行表面處理（目前普遍使用），可以很好的改善阻燃劑在材料中的分散情況。

阻燃劑的另一個問題就是會降低材料的耐光性，而且光穩定劑受阻胺的效果為鹵系阻燃劑嚴重惡化。無機阻燃劑在此方面會稍優于鹵系阻燃劑，例如，氧化鋅就能大大降低這類添加劑的熱老化時間。

與阻燃材料有關的問題還有價格、回收、生態等，一般而言，阻燃材料的價格比未阻燃的要高些，阻燃材料的循環再利用也比未阻燃材料困難。盡管使用阻燃材料是需要付出成本的，但是權衡阻燃產品在當今社會中，提高防火安全性，減少火災中人民生命財產的損失及環境保護方面的突出貢獻，阻燃仍然是我們必要和明智的選擇。

在阻燃過程中，大多廠家都采用裝木材→加阻燃劑→加水→開始阻燃的順序。一般說木材剛開始是吸水量大的時候，采用該工藝往往造成木材開始吸收的是濃度極低的阻燃液，這樣在木材阻燃過程中，還需要一個使木材所吸收阻燃液濃度由低濃度向正常濃度過度的過程，直接影響了木材的干鹽吸收量和吸收速度，進而影響了阻燃效果。而采用加阻燃劑→加水→裝木材→開始阻燃的順序，木材一開始所吸收的就是標準濃度的阻燃液，從而避免了木材吸收的阻燃液由低濃度向正常濃度過度的過程，進而提高了阻燃質量。如果企業有條件的話，能先將阻燃劑配制成規定濃度的阻燃液后再加入阻燃池中，阻燃質量將更好。